五代以后，黄河流域又进入分裂时期，如五代十国及北宋与辽（契丹族）、夏（党项族）和南宋与夏、金（女真族）的对峙，前后长达370余年。这期间沙陀、契丹、党项和女真族先后成为黄河流域的统治者族，并与汉人通婚，学习汉文化。
  元代统一后，进入中原的蒙古人是统治者族，而党项人与西域各族则被称为“色目人”，契丹、女真人与北方的汉人则被称为“汉人”。这些进入中原的各族也都逐渐融入汉族中。明时河套地区的汉人大批蒙古化，而元代进入黄河流域的一部分中亚色目人，由于信仰伊斯兰教，并长期与西北各族相处，遂形成回、东乡、撒拉、保安等族；而十六国时期的吐谷浑，因后来主要与藏族杂居，信仰喇嘛教，遂又形成为西北的土族。
  清代是满族建立的，满蒙八旗和官吏遍布全国，一部分融入汉族中，并形成以汉满蒙回藏为主的并存格局，标志着黄河流域第三次民族大融合的结束。