正院南北房和东北角小楼均为客房。南面是展销玉石的玉石宫，门前摆放着一把太师椅，是用上百年的老树根雕成的，寓意根成百年，添寿添福，时常有人到上面坐一坐。

女眷楼

第三个院子是女眷楼，又叫南楼小院，它是女性宾客和部分女佣人住宿的地方，位于公馆建筑群的西南角，南可通花园，北与伙房、侍从院相连，是古典回廊木结构的中式二层楼四合院，一楼是女佣住的，二楼是女宾住的，这个楼当年绝对禁止男人入内。

2004年政府修建的时候，将这个院落辟为青海省民俗博物馆。在这里游客可以通过汉族、藏族、蒙古族、撒拉族、回族、土族等在青海居住的民族服饰冠履、饮食起居、民间工艺和社会习俗等方面的展品和场景陈列，了解青海的地域特色和风土人情。

附属院子

第四个院子是小花园，大伙房和小伙房也在此院。

第五个院子是马步芳亲信警卫部队的驻地，称为“警卫楼”。院子里还有古油坊，古水磨。

第六个院子是仆役、车夫住的地方，现开辟新作为游客的购物和就餐场所在临街开放。

2004年将公馆修复，开辟为西宁市市区内唯一的人文古迹旅游景区，在这里游客可以通过实物，了解到青海近百年的一段历史和马步芳及其家人在青海的生活情况。