区内汇水全部流入柴汶河经大汶河后注入南水北调东线主要调蓄湖泊—东平湖，因此，保护区建设对保护东平湖水质起到了重要作用。

保护区内森林茂密，物种丰富，植被群落稳定，生态系统长期处于动态平衡状态，其生物多样性有极高的保护、利用价值，包括直接利用及生态、科研、美学等价值，同时具有不可估量的内在价值和潜在价值，如物种基因库的保护等。

保护区有多样的生态系统，优美的自然环境，秀丽的山水风光，古老的人文情韵，淳朴的民俗风情。蓝天、绿水、奇石、峭岩、森林、飞鸟融为一体，具有极高的生态旅游开发价值。保护区内有山海拔400m以上的山头73 座，主峰太平顶海拔813.6m，山上有99条峪，每条山峪都有奇特的自然风光，绝壁之上，奇松俏立，藤蔓倒挂，溪水潺潺，松涛阵阵。是新泰南部边界上一道绿色天然屏障。

保护区在保护管理中坚持在核心区仅限于严格依法开展科学观测活动，实行绝对保护；在缓冲区主要开展科学研究活动；在实验区可从事各种科学实验、教学实习、参观考察以及驯化、繁殖野生动植物等活动。