瓜州县博物馆位于甘肃省瓜州县县府街20号，成立于1988年4月，1992年3月11日，迁至县府街55号办公，同年4月破土兴建新馆，次年9月22日，大楼主体竣工，占地面积5400平方米，建筑面积1750平方米，其中，展厅面积700平方米，文物库房面积320平方米，其外观造型集中体现了唐瓜州锁阳城雄伟壮观的建筑风格。

瓜州县博物馆与瓜州县文物局一套人马，两块牌子，为正科级事业单位，隶属县文化体育局管理。核定事业编制16名。内设办公室、文物股、博物馆股、安全保卫股、锁阳城遗址（东千佛洞石窟）文管所。

瓜州县博物馆现有馆藏文物1800余件，其中一级文物13件，二级文物52件，三级文物82件，分为18个基本类别。

瓜州县博物馆集历史革命文物，人文地志、民俗风情、自然资源标本陈列于一体的综合性地方博物馆。基本陈列有《瓜州文物展》、《东千佛洞西夏壁画精品展》，共展出文物146件，壁画临摹品10幅，展线长度88米，较系统地反映了瓜州4000年历史文化概况。1995年12月，被中共酒泉市委列为爱国主义教育基地。