明朝弘治年间黄河再次决口，贾鲁河淤塞，明政府在治理黄河的同时，也对贾鲁河进行了疏浚，并对河道两岸进行了较大规模的修整。至此，贾鲁河迎来了自北宋以来第二个漕运的黄金季节，其繁荣达到了顶峰，据说当时贾鲁河上的朱仙镇码头日泊船２００艘以上，考古学家在此挖掘出相当重量的船锚，证明当时贾鲁河上曾行驶过载重量相当大的货船。穿越历史的时光，仿佛依稀可见滔滔河水上来往穿梭的船只，码头上正弯腰屈身紧张劳作的民工，岸边堆满了来不及搬走的各种货物和粮食，车水马龙的街市上传来阵阵的叫卖声，船工的号子悠扬而动听……

贾鲁河的这种繁盛局面一直持续到清朝中叶，１９世纪末黄河再一次泛滥，贾鲁河又一次淤塞，此后水流逐渐缩小，终于无法通航，所有的繁华不复存在，成为历史的过往。

落寞而平静，这种状态伴随着贾鲁河走过近现代，一直走到今天，虽然它已无法承担繁重的运输，但作为郑州市民生活和工业用水的第二水源，仍然在造福中原。

贾鲁河在荥阳的走向是自南向北，途中有丁店，楚楼，河王，唐岗等几座中型水库分布于河道，在荥阳东北部向东北改向，北环绕郑州市区，并从中牟县、开封市往东南方向。所以在地图上看似郑州市里黄河很近，但其辖区有相当一部分却不属于黄河流域，而属于淮河流域。但是，由于荥阳北部地区历史上曾是黄河溢出造成的沼泽（即荥泽），它与现今的贾鲁河河道很近，所以现在当地的区域归属已经不是很清晰。现在，贾鲁河荥阳段现在发挥着养殖、发电、灌溉、旅游等多重效应，为当地人经济发展做了不可忽视的作用。